[Curso]Optimización de aplicaciones Computacionales orientadas a la investigación

• Introducción: Arquitectura de los recursos compartidos HPC: Hardware, Lustre, Sistema de colas SLURM y Módulos.
• Tipo de software instalado: Restricted, Campus y FOSS. Herramientas de compilación y librerías. GitLab como repositorio. Uso de entornos virtuales en Python. Uso remoto del software y pasarelas (Cliente/Servidor).
• Envío de trabajos en serie y paralelo. Uso de las GPU. “Benchmark” de la paralelización del cálculo a realizar, optimizando el número de GPUs, cores y/o nodos y memoria a través de SLURM.
• Ejemplos de buenas prácticas en el envío de trabajos a SLURM a las aplicaciones mas usadas en el CSIC (Gaussian, Materials Studio, GROMACS, AMBER, …)
• Uso de las cuotas de almacenamiento. Buenas prácticas para la transferencia de ficheros. Petición de recursos especiales.